AMPとオリジナルページのあいだで、Googleの評価は分散しませんか

いいえ、しません。AMPの仕組みとして、AMPページとペアリングされるオリジナルページがある場合、Googleの評価対象は、オリジナルページのみとなります。

そのため、Publication Networkを利用して作成するAMPページはPublication Networkがホスティングしていますが、オリジナルページとペアリングしているため、評価結果はオリジナルページのほうに蓄積されます。

Publication Networkでは、下記の仕様に沿って、AMPページとオリジナルページをペアリングしています。

ページが検出されるようにする – AMP